رئاسة الازهر لم يزل مستمرا على ملازمة التدريس مع القيام بشؤون المشيخة .
وكان عباس باشا يزوره في درسه بالازهر ولا يقوم له بل يهيئ له كرسيا من جريد يجلس عليه خارج الدرس .
ولم يزل الشيخ على هذا الحال إلى أن كبر سنه .
وحصل بالازهر حوادث أوجبت اقامة أربعة وكلاء عنه للقيام بواجبات الوظيفة تحت رئاسة الشيخ مصطفى العروسي 1 التحفة الخيرية وهي حاشية على الفوائد الشنشورية ( فرائض المذاهب الاربعة ) أولها : الحمد لله الذي يرث الارض ومن عليها وهو خير الوارثين أتمها تأليفا سنة 1236 : مط شاهين 1282 مط محمد مصطفى 1300 المط الازهرية 1306 ص 280 الميمنية 1308 ص 226 2 تحفة المريد على جوهرة التوحيد لبرهان الدين اللقاني .
وبالهامش الجوهرة المذكورة بولاق 1293 مط وادي النيل 1279 الميمنية 1306 ص 128 الازهرية 1310 ص 126 3 تحقيق المقام على كفاية العوام فيما يجب عليهم من علم الكلام وهي حاشية على كفاية العوام للفضالي أول الحاشية : الحمد لله العالم بالكليات والجزئيات .
ألفها باذن شيخه ( الفضالي ) وفرغ من جمعها سنة 1223 بهامشها كناية العوام المذكور بولاق 1285 و 1291 و 1309 ص 81 مط الازهرية 1298 الوهبية 1298 الخيرية 1303 مط عبد الرازق 1306 الميمنية 1328 4 حاشية الباجوري على أم البراهين والعقائد للسنوسي ( توحيد ) بهامشها تقرير الشيخ احمد الاجهوري بولاق 1293 ص 68 مصر 1300 و 1301 و 1302 بهامشها تقرير الشيخ الانبابي طبع حجر مصر 1279 و 1283 و 1289 ص 88 و 1298 و 1304 و 1307 و 1310 و 1318